外國公司在日本設立公司，可以選擇成立: 股份公司（株式会社（KK）），有限責任公司（合同會社（LLC））或日本公司法規定的類似實體。該公司是獨立的法人實體。
「代表處」是為協助海外企業從事籌備及輔助的工作，目的是使外國公司能夠在日本開展全面的業務活動。
「代表處」可以進行市場調查、收集信息、購買商品並進行宣傳 / 廣告工作，但不允許從事銷售活動。「代表處」不需要註冊，亦無法以自己的名義開立銀行帳戶或租賃房地產，必須由外國公司總部或「代表處」代表以個人身份簽署協議。
在日本開展業務的外國公司，可設立「分支機構」。
「分支機構」一經註冊，便可以開始業務運營。該「分支機構」是由外國公司授權在日本的營業地點，通常沒有獨立的決策權。「分支機構」並非獨立的法人實體，因此，外國公司必須對該「分支機構」的活動所產生的所有債務和信貸，承擔最終責任。
合資企業，是指由兩個或多個參與方共同開展經濟活動的實體。雙方同意通過共同出資建立新實體，然後由他們共享企業的收入，支出和控制權。